草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿程序最先见的皮肤疾病中的一种。肾策划 中CaOx多晶体过饱合沉淀积累会促使肾小管体细胞破损和凋亡，进而促使肾结石的带来。短链皮下脂质酸由胃肠腔内厌氧厌氧发酵日常细菌厌氧发酵膳食结构玻璃纤维带来，不只在边缘胃肠腔第一道防线中挥发功用，而是在程序情况上也挥发关健功用。中仅，丁酸是最丰富性的短链皮下脂质酸，具备有抗感染和免役克制功用,本科研研讨丁酸对CaOx肾结石的功用简述因素靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山宠物医院泌尿整形外科吴忠硕士生导师、周子健研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠客座教授、周子健搏士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了线上临床药理学服务管理，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

小文章英文名称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 潜在客户厂家：华山医院专家 探究相亲对象：大鼠、HK-2体细胞 分成小组相关信息：差表组（Con）、型号组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱出示技能：在线药理学学论文检测

思绪方法图

论述结杲

实验人群要搭建大鼠模形，使用生理学什么是生化指标体系和安排方面的问题学固色等实验技术手段显示丁酸可能减小CaOx模形大鼠肾CaOx结晶的变成和直接拉伤，缓解CaOx模形大鼠的疾病直接拉伤和硫化物化学物质的过多展现。显然，丁酸还可有抑制草酸诱发的HK-2受损受损细胞直接拉伤、硫化物应激性和受损受损细胞凋亡。 为与探讨丁酸架构和靶表观遗传组手机数据网路，钻研考生从PubChem得到丁酸和丁酸酯的二维和3d架构（图1A）。采用PharmMapper资料库和Uniprot资料库实行处理后共建立出1115个丁酸靶表观遗传组供进几步探讨。将表观遗传组下拉列表带到STRING资料库，实行PPI手机数据网路探讨。Cytoscape得出了去重复的前20的交通交通交通核心站靶表观遗传组的详情手机数据网路图，也包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这一些交通交通交通核心站表观遗传组与手机数据网路中的一些表观遗传组均具体表现出肯定的一些性，解释这一些表观遗传组可以性挥发着协同管理做用。GO和KEGG探讨阐明了丁酸交通交通交通核心站表观遗传组的一些有效经过和生物体技术学技能（图1C）。交通交通交通核心站表观遗传组比较决定性是与类固醇的荷尔蒙初次初次应答、被氧化的应激性状态初次初次应答、化学活化酶类氧组织细胞对类固醇的荷尔蒙多种多样的现象以其对咸性化学式化合物的现象有关于。与此同时指出，这一些交通交通交通核心站表观遗传组比较决定性是体验了被氧化的应激性状态和对化学活化酶类氧的生物体技术现象过程中 ，是肾结石演变成考核机制中至关比较决定性的有效经过，这表示丁酸可以性在肾结石中挥发比较决定性做用。

图1| 丁酸机构与靶遗传基因网路具体分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进每一步探寻丁酸对CaOx肾结石当然切靶人类表观遗传，研发技术成员再生利用GEO的网站数据显示库对GSE73680中身心健康对比与CaOx肾结石用户的人类表观遗传差异性使用了研发。对比组与CaOx结石用户的偏态性性能差异性表示人类表观遗传（DEGs）产前筛查标淮为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个人类表观遗传发生的偏态性决定，这里面3379个（89.4%）人类表观遗传表示调整，404个（10.6%）人类表观遗传表示下跌（图2A）。对DEGs使用聚类分析分享分享，热图显视了前10个被选中DEGs的二维等级聚类分析分享特证（图2B）。继而，研发技术成员能够GeneCards的网站数据显示库人工客服监定了370个已经与CaOx肾结石重要性的人类表观遗传，优化前20位的予测人类表观遗传十分重要性性評分如图已知2C如下。为找寻到丁酸开展CaOx肾结石的重要靶点，研发技术成员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石重要性人类表观遗传处里赢得了了个Venn图。终极，CYP2C9被判断为丁酸决定CaOx肾结石的隐藏靶点(图2D)。凡此种种，研发技术成员还使用了丁酸与CYP2C9的大分子嫁接，CYP2C9的四个氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸能够 功效，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在利用率互联网药学学估计CYP2C9是丁酸危害CaOx肾结石的靶染色体后，研发成员还可以通过上皮细胞膜测试印证了CYP2C9可大幅度降低草酸促进的HK-2上皮细胞膜的ROS程度、疾病断裂和凋亡。

图2| 大多据库联合技术剖析预估CYP2C9是丁酸意义于CaOx肾结石的靶遗传基因

研究方案最后

本研究探讨先是出现 丁酸在身体外和里面均能可能够限制CaOx肾结石建模的钝化应激状态反应和慢性支原体感染拉伤，接着在互联网药理学学学淘汰收获丁酸关系CaOx肾结石的隐性靶点——CYP2C9，接下来在上皮体细胞进行实验确认CYP2C9在草酸盐引导的HK-2上皮体细胞ROS品质、慢性支原体感染拉伤和凋亡。一些出现 揭示丁酸将在可能够限制CYP2C9来可能够限制CaOx肾结石的钝化应激状态反应，减小慢性支原体感染拉伤。这类方式中拜谱微生物学打造了互联网药理学学学方法业务保障，显然拜谱微生物学可升高发育成熟进一步完善的什么是基因组学、核氨基酸组学、排泄组学等多个学產品及方法业务保障，喜欢致电的方式咨询了解。！ 参考资料专著：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.