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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已体现出广的菌物灵活性，例如抗癌症和抗病性毒的作用。一般说来，三萜是依据甲羟戊酸路线炼制的，并从非天然绿植的和真菌孢子中转化成。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上刊发了一篇“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的探讨本文。该探讨出现三萜类化学物质虫草粉酸（GA）是顺利通过药液锻炼的无柄虫草粉菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的动物还原成形成的。可以通过转录组和蛋清质组学技术设备性进三步经历无柄野生野生灵芝菌丝体中DHT形成四种野生野生灵芝酸（GA）的管理机制，并不同几组学技术设备性检侧到的不同之处基因遗传和不同之处蛋清，推算DHT 动物结合 GA 的前提条件。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录多组分析和职能种类

按照对无柄虫草真菌孢子菌丝体实行转录组测序共能够得到67230个转录本和14299个单染色体遗传。在一些单染色体遗传中，49俩被鉴定费为区别表明爱染色体遗传（DEGs），至少213个表明爱调整，279个表明爱下跌（图1A）。GO聚集介绍后，DEGs为生物制品工作（BP）、组织因素（CC）和原子核作用（MF）3类。在BP专业类属中，存在了前四个子专业类属：消炎药进行分解排泄工作，冰醋酸盐排泄工作和甲酸盐排泄工作;而在CC专业类属中，组织外区、突触软型体、突触组成部分是前四个亚类。谈谈MF专业类属，甲酸脱氢酶（NAD）灵吸附性氧、氧化物备份酶灵吸附性氧和酸氨（或酰胺）接酶灵吸附性氧是前四个亚专业类属（图1B）。在DEGs的KEGG通道介绍中，前30条聚集度极高的通道中含27条一种排泄，至少甲烷气体排泄、乙醛酸盐和二羧酸盐排泄、丙酸盐排泄数字信号通道偏态聚集（图1D）。

图1|转录多组分析和作用分为

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

用对无柄虫草真菌孢子菌丝体做氨基酸质组学了解，总计有知道了16,457种独具特色肽、2606种氨基酸质和2588种按量氨基酸质。在域值|FC|>1.2和p<0.05的建立必备条件下，在此2606种氨基酸质中，94种被检验为的相互影响表现氨基酸（DEPs），之中52种上涨，42种调低（图2A），图2C表现了的相互影响表现氨基酸的聚类浅析了解热图。从GO了解看你，BP种类表现，多半数DEPs进入醋酸钠盐组织组织新陈分泌全全过程中、消炎药细化组织组织新陈分泌全全过程中和性药物细化组织组织新陈分泌全全过程中。CC类DEPs在组织外区、过防氮化合物酶体和微体中比重较高的，防硫化备份酶抗逆性和甲酸脱氢酶（NAD）抗逆性在MF类中DEPs的比例图较高的（图2B）。与转录组但是相像，KEGG径路了解表现，成千上万DEPs在组织组织新陈分泌中生物技术技术生物技术技术富集，之中3条最生物技术技术生物技术技术富集的手段是光合生物技术技术中的碳固定的、碳组织组织新陈分泌和MAPK走势径路（图2D）。因此，用了解GO数据表格库的CC对DEPs做亚组织定位系统了解和批注（图2E），DEPs核心匀称在组织质（40.66%）、组织膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），认识论上是GAs生物技术技术人工的核心方位。

图2|血清质组的化学发光法分折和性能查证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

谋生物被转化和相较比较组侯选DEGs和DEPs设计制作了维恩图，有20个不一致性展示出来人类表观遗传（图3A）。对转录组和血清质组中E组和C组共出的DEGs/DEPs做好聚类浅析法浅析，出现mRNA和血清质直接有14个上浮人类表观遗传和4个调整人类表观遗传，DEGs与他全文翻译的DEPs展示出来平行呈正各种涉及到的，根据Pearson的各种涉及到的常数浅析，在转录组和血清质组直接检侧到相对应较高的各种涉及到的性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）测量结论呈现，E组和C组1一DEGs的呈现情况地域差异可观，这之中9个为调涨DEGs，5个为调整DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的呈现态势与转录类物质析结论高度。

图3|蛋白酶质组的参考值深入分析和功能模块安全验证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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