
2024年9月由长沙农林二本大学张万刚教受微商团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱微生物为该研究提供了亚硝基化遮盖组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
常常网站标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202几年影响力要素:5.7
刊出时间段:2024年9月
客服公司的:南京农业大学
探索涂料:蛋白
拜谱供给技术性:亚硝基化修饰组学
技艺路径:
一、的研究结论
01.Caspase-3化学活化
迄今为止尚不清除NO对caspase-3的控做用是否是归因于NO介导的S-亚硝基化,有差异质量浓度梯度方向的GSNO有所作为外源性NO供货,以引发caspase-3的身体之外S-亚硝基化。效果表面,与没得GSNO的组相比之下,100、200和400μM GSNO组的caspase-3可溶性强势缩减(图1),与原本新闻同步。GSNO整理缩减caspase-3可溶性的内在的缘由仍存在不足相一致。
图1 区别酸度的GSNO处置对caspase-3化学活化的直接影响
02.Caspase-3的S-亚硝基化因素
科研Caspase-3的亚硝基化水平,以是因为GSNO对Caspase-3的作用性。经GSNO处理后,监测到caspase-3蛋白酶S-亚硝基化效果增强(图2)。这么多结杲是因为,外源性GSNO致力于可成功失败帮助caspase-3的休外S-亚硝基化。真让人诧异的是,在没GSNO会出现的相较比较组中监测到同一个较弱的S-亚硝基化带,这是因为caspase-3将会进行内源性的S-亚硝基化。另外,本科研中caspase-3的S-亚硝基化水平较高,而caspase-3的活力性降底,这与以前的科研统一。那么,caspase-3的特情人S-亚硝基化遮盖位点尚不知晓,还是需要进一个步骤的探索性。
图2 GSNO除理对caspase-3S-亚硝基化情况的决定
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化表达组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。颜色标识的字段标识S-亚硝基化肽,颜色标识的C标识S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3可降解结球蛋白
结核球球蛋清作另一种关键的人体生殖细胞骨架核球球蛋清,在保护肌人体生殖细胞组成部分的组成部分完美性和紧缩性地方起着关键影响,探讨S-亚硝基化caspase-3对结核球球蛋清可化学降解的明情绪化具关键积极意义。与Std(未用胱天核球球蛋清酶-3和GSNO孵育的默认肌钎维核球球蛋清)组较之,0 μM GSNO组(肌原钎维和caspase-3的孵育,无GSNO)的完美结核球球蛋清分量重要减少,报错caspase-3对结核球球蛋清具风险的核球球蛋清油脂水解专业能力。在GSNO孵育后,完美结核球球蛋清的分量比较突出增长(P < 0.05)。不但,当GSNO浓硫酸浓度提升时,完美结核球球蛋清的分量长期调涨(P < 0.05)(图5)。相应出现表述,SNO体现的caspase-3以含量依耐的玩法控制结核球球蛋清的可化学降解。
图5.S-亚硝基化caspase-3挥发结核蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3挥发肌钙淀粉酶-T
肌钙蛋清酶-T (TnT)是原肌球蛋清酶调接开展肌肉群紧缩的细细的的须要肌原钎维蛋清酶。TnT的溶解的特征是测量到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化必备条件下,caspase-3对TnT的溶解情况报告如图所显示6所显示,与Std组(包括caspase-3和GSNO的肌原钎维)相对于,caspase-3组中30 kDa TnT情节正相关增长,反映caspase-3参入了TnT的溶解,凡此种种,caspase-3与GSNO的孵育会产生30 kDa TnT下滑。在100和200 μM GSNO组相互不会测量到不错的对比分析(P > 0.05),而当GSNO的渗透压符合400 μM 时,该情节正相关调低(P < 0.05)。这个察觉到反映了SNO遮盖的caspase-3对TnT溶解的抑止效果。结蛋清酶和TnT是caspase-3的明感底物,而GSNO进行处理调低caspase-3的吸附性几率会产生肌原钎维蛋清酶溶解系数调低。由此可见综合上面的分析我们可看出,NO成脂的S-亚硝基化可经过遮盖半胱氨酸残基来调接caspase-3的吸附性,从根本上进一次干扰力其对结蛋清酶和TnT的蛋清酶溶解能力素质,而使干扰力牛羊肉好品质。
图6. S-亚硝基化caspase- 3吸附肌钙蛋清-T
二、总结
本设计有赖于探析S-亚硝基化对caspase-3突显语的作用简述随即对牛羊肉肌原玻璃纤维板离体生物降解的作用。血清S-亚硝基化不错突显语caspase-3的半胱氨酸残基,而使诱发caspase-3亲水性变低,进一部抑制性了其对牛羊肉肌原玻璃纤维板血清的血清溶解业务能力。三、拜谱总结ppt
调查分为了酶活法测定,亚硝基化掩盖组学讲解,WB等检则的方法,察觉到核核核蛋清S-亚硝基化都可以掩盖caspase-3的半胱氨酸残基,这造成的了caspase-3生物的变低,相结一部房产调控了其对牛羊肉肌原氯纶核核核蛋清的核核核蛋清电离本事。本调查为解答核核核蛋清质亚硝基化对肉嫩的房产调控机能提拱好几回个新的视野。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的蛋清质组学、呈现蛋清质组学、分解代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系列护肤品护肤品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺硝化作用、total脱色复原、存在巯基,欢迎大家咨询!
决定性论文文献:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663